Μια φτηνή μέθοδο για την παρακολούθηση της εξάπλωσης νέων παραλλαγών SARS-CoV-2 στον κόσμο, ανέπτυξαν ερευνητές του Karolinska Institutet στη Σουηδία.
Από την έναρξη της πανδημίας, χιλιάδες γονιδιώματα του ιού παρακολουθούνται με τη μέθοδο της γονιδιακής αλληλούχισης, προκειμένου να διαπιστώνουμε την εξέλιξη του κορωνοϊού στην παγκόσμια εξάπλωσή του. Η διαδικασία αυτή είναι ιδιαίτερα σημαντική, προκειμένου να γνωρίζουμε τις μεταλλάξεις που δημιουργούν νέες παραλλαγές του ιού, να τις εντοπίζουμε και να διαπιστώνουμε αν είναι πιο μεταδοτικές, πιο παθογόνες ή αν είναι ανθεκτικές στα υπάρχοντα εμβόλια.
Για την παγκόσμια παρακολούθηση του γονιδιώματος του νέου κορωνοϊού, είναι ζωτικής σημασίας η αλληλούχιση και ανάλυση πολλών δειγμάτων, με οικονομικά αποδοτικό τρόπο. Γι’ αυτό, ερευνητές στο εργαστήριο Bienko-Crosetto του Karolinska Institutet and Science for Life Laboratory (SciLifeLab) στη Σουηδία ανέπτυξαν μια νέα μέθοδο, που ονομάζεται COVseq και η οποία μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την επιτήρηση του γονιδιώματος του ιού σε μαζική κλίμακα, με χαμηλό κόστος.
Οι ερευνητές προχώρησαν σε σχετική δημοσίευση των ευρημάτων τους στο επιστημονικό περιοδικό Nature Communications.
Δημοσίευση
Κατ’ αρχήν, πολλά αντίγραφα του γονιδιώματος του ιού, δημιουργούνται χρησιμοποιώντας τη λεγόμενη πολλαπλή PCR (αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης). Στη συνέχεια μπαίνει σήμανση στα δείγματα, τα οποία συγκεντρώνονται στην «βιβλιοθήκη» αλληλουχιών, με τη χρήση μιας προηγούμενης μεθόδου που αναπτύχθηκε στο εργαστήριο Bienko-Crosetto και το οποίο έχει προσαρμοστεί για αναλύσεις του SARS-CoV-2.
«Με την εκτέλεση αντιδράσεων σε πολύ μικρές ποσότητες και τη συγκέντρωση εκτατοντάδων δειγμάτων στην ίδια «βιβλιοθήκη» αλληλουχιών, μπορούμε να αλληλουχίσουμε δυνητικά χιλιάδες γονιδιώματα του ιού την εβδομάδα, με κόστος μικρότερο από 15 δολάρια ανά δείγμα», λέει ο Ning Zhang, μεταδιδακτορικός ερευνητής στο Τμήμα Ιατρικής Βιοχημείας και Βιοφυσικής του Karolinska Institutet και πρώτος συγγραφέας μαζί με τους διδακτορικούς φοιτητές Michele Simonetti και Luuk Harbers από το ίδιο τμήμα.
Συγκριτικές αναλύσεις 29 θετικών δειγμάτων SARS-CoV-2 αποκάλυψαν ότι το COVseq είχε παρόμοια ικανότητα με την τυπική μέθοδο για τον εντοπισμό μικρών αλλαγών στο γονιδίωμα. Οι αναλύσεις 245 πρόσθετων δειγμάτων έδειξαν ότι το COVseq είχε επίσης υψηλή ικανότητα να ανιχνεύει αναδυόμενες παραλλαγές κορωνοϊού που ενδέχεται να ανησυχούν. Το βασικό πλεονέκτημα του COVseq έναντι των υπαρχουσών μεθόδων είναι η αποδοτικότητά του, σε σύγκριση με το κόστος.
«Η φθηνή μας μέθοδος θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί άμεσα για τη παρακολούθηση του γονιδιώματος του νέου κορωνοϊού από τις υπηρεσίες δημόσιας υγείας και θα μπορούσε επίσης να προσαρμοστεί εύκολα για την παρακολούθηση και άλλων ιών RNA, όπως οι ιοί της γρίπης και του δάγκειου πυρετού», λέει ο Nicola Crosetto, ερευνητής επικεφαλής του τμήματος Ιατρικής Βιοχημείας και Βιοφυσικής του Karolinska Institutet και εποπτεύων συγγραφέας της μελέτης.
Η μελέτη πραγματοποιήθηκε σε συνεργασία με ερευνητές από το Νοσοκομείο «Amedeo di Savoia» και το Ινστιτούτο Καρκίνου Candiolo του Τορίνο της Ιταλίας. Η έρευνα υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το εθνικό ερευνητικό πρόγραμμα SciLifeLab COVID-19 και από το Σουηδικό Ίδρυμα Στρατηγικής Έρευνας, χρηματοδοτήθηκε από το Ίδρυμα Knut και Alice Wallenberg, ενώ δέχθηκε και δωρεές από τις εταιρείες Chiesi Pharma AB και Tetra Pak AB.
Latest News
Πόσα δαπάνησαν οι Έλληνες από την τσέπη τους για την Υγεία το 2023
Τι δείχνουν τα στοιχεία για τις δαπάνες του δημοσίου - Σε ποια κατεύθυνση κινήθηκαν οι δαπάνες των πολιτών
Πόσο τοξική είναι η αφρικανική σκόνη - Τι να προσέξετε
Για τις ευπαθείς ομάδες, συνήθως χρειάζεται μια εντατικοποίηση της αγωγής είτε αυξάνοντας τη δόση του φαρμάκου είτε τη συχνότητα, λέει ο κ. Βασιλακόπουλος
Fika ή αλλιώς εργασία και χαρά – Οι Σουηδοί δείχνουν τον τρόπο
Πάρτε τον συνάδερφό σας, βγείτε για έναν καφέ, συζητήστε και θα σας βγει σε καλό
Οι έννοιες του Νοήματος και της Διαδικασίας στο σύγχρονο Μάνατζμεντ
Η κατανόηση πρέπει επιτακτικά να αντικαταστήσει τη ξέφρενη διαδικασία, διαφορετικά το μάνατζμεντ θα συνεχίσει να είναι μια απανθρωποποιημένη βιομηχανία τέτοιων παράλογων κανονισμών
Ποιοι κλάδοι στην Ελλάδα έχουν επιτύχει πλήρη ισότητα των φύλων στην εργασία
Γεμάτος προκλήσεις ο δρόμος προς την ισότητα στον χώρο εργασίας - Οι εργοδότες κερδίζουν με πρωτοβουλίες και καινοτομία
Επιστροφή στα σινεμά - Πόσα εισιτήρια κόπηκαν το 2023
Η ετήσια έκθεση του Ευρωπαϊκού Οπτικοακουστικού Παρατηρητηρίου για την κίνηση των κινηματογράφων και τα στοιχεία για την Ελλάδα
Λαζαράκου: «Βελτιώνουμε περαιτέρω το πλαίσιο για την εταιρική διακυβέρνηση»
Η πρόεδρος της Επιτροπής Κεφαλαιαγοράς μιλάει στο «Βήμα» σημειώνοντας και την ενίσχυση των εργαλείων εποπτείας ώστε να αντιμετωπιστούν καλύτερα σκάνδαλα τύπου Folli Follie
Αισιόδοξο μήνυμα από CEOs - «Αλώβητες» οι επιχειρήσεις από πολέμους και επιτόκια
Το 58% – σχεδόν τριπλάσιοι σε σχέση με τον Ιούλιο του 2023 – επιταχύνουν τα σχέδια μετασχηματισμού των επιχειρήσεών τους
Προετοιμασία στην Ε.Ε. για τον άγνωστο ιό της «νόσου Χ»
Στο «μικροσκόπιο» των λοιμωξιολόγων της Ευρώπης, μπαίνει κάθε γνωστό και άγνωστο παθογόνο βακτήριο και ιός
Αυτά είναι τα έσοδα που θα λάβουν οι ομάδες στο νέο Champions League
Η UEFA γνωστοποίησε τον τρόπο με τον οποίο θα γίνει η διανομή των εσόδων στις ομάδες που θα λάβουν μέρος στο νέο Champions League.